自2021年7月30日寧夏確診外省輸入病例張某某，7月31日22時采集到合格基因測序標本，中心領導立即部署深度測序工作，組織專業技術人員，日夜不停地開展測序工作，通過文庫制備、簇生成、上機測序與數據比對分析，最終在36小時后，于8月2日完成該病例全基因組測序，確定該標本為德爾塔毒株。通過與國家疾控中心的數據庫比對，該病例基因組序列和江蘇省7月24日以來報送本土病例新冠病毒基因組完全一致，共享全部突變位點，高度同源。此次基因組測序工作的完成，標志著寧夏疾病預防控制中心已具備新冠病毒基因組高通量二代測序能力，可為寧夏新型冠狀病毒疫情以及其他傳染病病原體的鑒定和溯源、防控應對提供技術支撐。
基因組測序可在第一時間獲取新發未知病毒的基因組序列信息，已成為研究疾病暴發的重要工具。通過構建進化樹，研究不同患者病毒遺傳序列變化，能在分子生物學層面揭示病毒的傳播方式，分析新冠病毒的進化來源，研究新冠病毒的致病病理機制，為控制疫情暴發提供科學依據。通過檢測新冠病毒的全基因組序列，再將這個序列通過算法與數據庫中的數據進行比對，可以初步判斷其地域來源。將序列與既往病例序列進行比對，如果序列在同一進化樹分支上，則可以判斷這些病例是否來自同一傳播鏈或傳染源。
此次疫情病原體為德爾塔變異株，德爾塔變異株與其他變異株相比，在S蛋白上新增了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要突變。這些突變導致病毒具有傳播力強、潛伏期短、病毒載量高、病程進展快等特點。在此提醒廣大群眾，減少聚集，保持社交距離，防止疫情擴散。
相關文章推薦
-
病毒學檢驗科 2020-09-11
-
勒索病毒篇 2022-04-02
-
病毒防御篇 2022-04-01
-
新冠疫苗“加強針”來了！ 2021-10-22
